spower show test SKAT
spower LOGIT Kryukov2009European1800.sfs --def_rare 0.01 --def_neutral -0.00001 0.00001 --moi A --proportion_detrimental 1 --proportion_protective 0 --OR_rare_detrimental 1.5 --OR_common_detrimental 1 --baseline_effect 0.01 --sample_size 1000 --p1 0.5 --limit 1 --alpha 0.05 --method "KBAC --name K1 --mafupper 0.01 --maflower 0 --alternative 1 --moi additive --permutations 1000 --adaptive 0.1" --replicates 1000 --jobs 4 -o exercise
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spower show exercise.loci.csv effect*
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spower LOGIT Kryukov2009European1800.sfs --sample_size 1000 --OR_rare_detrimental 1.5 --method "CFisher --alternative 1 --name CMC" "KBAC --permutations 1000 --alternative 1" "WSSRankTest --alternative 1 --name WSS" "VTtest --alternative 1 --permutations 1000" "SKAT disease" -r 100 -j 4 -l 1 -o exercise
spower LOGIT Kryukov2009European1800.sfs --sample_size 1000 --OR_rare_detrimental $i --method "CFisher --name CMC$i" --title FixedOR$i -r 100 -j 4 -l 1 -o exercise2
done
==Unphased==